L'histoire fascinante de la première femme de science Alexandrie, Ve siècle. Hypatia enseigne la philosophie, les mathématiques et l'astronomie. Femme, baignée de savoirs grecs, dont la science contredit certains dogmes religieux, elle attire sur elle les foudres de plusieurs opposants. Dans cette époque politique troublée où le pouvoir de l'Empire romain se heurte aux volontés d'émancipation des Égyptiens et à l'implantation du christianisme, la fragile position d'Hypatia vacille. Et sa vie même en est menacée. Accompagnée de son jeune secrétaire Thonis, Hypatia se lance dans un voyage crucial à travers la Grèce.